Yuan1z0825/nature-skills

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Nature Skills 网页版：内置 Nature Polishing（论文润色）与 Nature Figure（科研绘图）核心功能，访问地址 https://natureskills.cn

nature-skills 面向全球 AI 学者收录可复用科研技能，强调真实问题解决、可验证工作流与可直接使用的科研产物。

• 1. 项目发起人与运营信息
  • 1.1 创始人介绍
  • 1.2 自营 GPT / Claude 代充与成品号
  • 1.3 知识星球
  • 1.4 商务合作
• 2. Skills 主要开发者
• 3. 项目理念与社区
• 4. 快速开始
• 5. 安装
  • 5.1 npx skills 安装方式
  • 5.2 Claude Code 安装方式
  • 5.3 Codex 安装方式
  • 5.4 Chatbox 安装与使用
  • 5.5 其他 Agent 场景
• 6. 技能索引
• 7. 贡献与开发
• 8. Star 历史

大家好，我是 nature-skills 的创立者袁一哲。感谢大家持续关注本项目。我们在抖音更新了许多视频教程，大家可以根据名称检索查看，希望能够真正帮助到科研工作。

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知识星球名称：Nature Skills 以及背后的哲学，以加入知识星球代替打赏。

如有商务合作意向，欢迎发送邮件至 natureskills2026@outlook.com。

• 最近发现，我设计的 Nature Skills 被谷歌 DeepMind 关注并借鉴，他们参考了其中的引用体系、脚本思路以及技能设计哲学，推出了 Science Skills。说实话，这让我挺欣慰的——当国外的顶尖 AI 机构开始从我们的工作中汲取灵感时，说明中国开发者的原创思想正在被世界看见。这不是被复制的失落，而是中国力量在开源土壤里生根后，自然向外生长出的影响力。
• 我们设计 Skills 的重心，从来不是要求每个人都来啃透这套思想，而是这套思想本身就具备被机器理解并复用的能力。你如果想创立一个全新的 Skill，或者把它适配到自己的专属领域，根本不需要从头学起——直接把 Nature Skills 的 GitHub 地址发给 Codex，它就能自动学习其中的设计精髓，帮你完成新 Skill 的创建和修改。这才是思想的真正解放：它不再依赖口口相传，而是通过 AI 直接流淌进每一个需要它的角落。
• Nature Skills 真正的价值，或许并不在于那些具体的技能模块，而在于它悄悄推开了一扇新的大门——它让很多人第一次意识到，原来可以借助 Codex 或智能体来操控本地电脑做科研。我有幸见证并陪伴了许多人完成科研范式的转变。当他们惊叹“原来科研还可以这样去做”的那一刻，这种认知上的破壁和解放，远比 Skills 本身更让我觉得有意义。它不是一个工具的成功，而是一种新的思考方式开始在人群中蔓延。
• 在当下，几乎所有实用的工具都可以被提炼为标准化流程，而标准化流程恰好可以封装成可复用技能。

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安装完成后，可以直接把论文、段落、审稿意见或任务描述交给 Agent。下面这些提示词可以直接复制使用：

如果你不确定该用哪个技能，直接描述任务即可；如果已经知道技能名，可以在提示词中明确写“使用 nature-reader”或“使用 nature-response”。

nature-skills 是一组围绕 SKILL.md 组织的可复用技能包。skills/ 下的每个顶层技能目录都是一个可安装单元，例如 nature-*；nature-shared 是供其他技能读取的共享支持包，默认不作为独立触发技能计入技能索引。

需要先安装 Node.js 18 或更高版本。无需全局安装 CLI；先查看仓库中可安装的技能名：

npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --list

优先按当前任务选择需要的技能，并保留其共享依赖。只为当前项目安装时，省略 --global；需要跨项目使用时再加上它。例如：

npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --agent codex --skill nature-figure --yes --copy

单独安装 nature-reader、nature-paper2ppt、nature-polishing 或 nature-writing 时，同时选择共享支持包：

npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --global --agent codex \
  --skill nature-reader --skill nature-shared --yes --copy

如果确实需要完整技能集，也可以全局安装到 Codex。全量选择包含 nature-shared：

npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --global --agent codex --skill '*' --yes --copy

需要把全部技能安装到 CLI 支持的所有 agent 时，使用：

npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --all

检查全局安装结果并更新：

npx skills list --global --agent codex --json
npx skills update --global --yes

只更新一个技能，或只更新当前项目中的技能：

npx skills update nature-reader --global --yes
npx skills update --project --yes

技能选择参数使用 --list 显示的 frontmatter 名称；例如目录 nature-proposal-writer 当前显示为 researchwrite。npx skills 管理的是技能文件，Python、R、浏览器或 MCP 等可选运行依赖仍需按下文说明单独配置。

Claude Code 不能直接使用 scripts/update-codex-skills.sh，因为这个脚本只负责同步到 Codex 的 ~/.codex/skills/。用于 Claude Code 时，推荐保留一个稳定的本地 clone，再用 subagent 或 slash command 指向真实的 skills/*/SKILL.md。这样不会破坏技能目录结构，也能继续读取 references/、static/、manifest.yaml、脚本、资产和 skills/nature-shared/。

如果还没有安装 Claude Code：

npm install -g @anthropic-ai/claude-code
claude

先把仓库 clone 到一个稳定路径：

mkdir -p ~/ai-skills
cd ~/ai-skills
git clone https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git

推荐方式：为常用技能创建 Claude Code subagent wrapper。以 nature-reader 为例：

mkdir -p ~/.claude/agents
cat > ~/.claude/agents/nature-reader.md <<'EOF'
---
name: nature-reader
description: Use for Chinese-English paper reading, figure-aware translation, and source-grounded paper notes.
---

When invoked, first read `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-reader/SKILL.md` and follow it as the governing workflow.
Read supporting files from `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-reader/` and `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-shared/` only when needed.
Do not replace this skill with a generic paper-reading response.
EOF

然后开启新的 Claude Code 会话，直接请求使用这个 subagent：

Use the nature-reader subagent to turn this paper into a Chinese-English Markdown reader.

如果你更喜欢 slash command，也可以创建命令 wrapper：

mkdir -p ~/.claude/commands
cat > ~/.claude/commands/nature-reader.md <<'EOF'
Read `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-reader/SKILL.md` first and follow it strictly.
Read directly needed supporting files from `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-reader/` and `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-shared/`.

$ARGUMENTS
EOF

在 Claude Code 中使用：

/nature-reader 把这篇论文做成中英文对照的完整 Markdown reader。

安装其他技能时，把示例中的 nature-reader 换成对应目录名即可，例如 nature-polishing、nature-writing、nature-reviewer、nature-response 或 nature-figure。后续更新只需要：

cd ~/ai-skills/nature-skills
git pull

只要 wrapper 仍然指向这个稳定 clone 路径，就不需要重复复制技能文件。

自动更新（可选）

如果你希望 Claude Code 每次开启会话时自动拉取上游更新，可以用 scripts/autoupdate-skills.sh 配合一个 SessionStart 钩子。

这套方式把技能直接复制进 ~/.claude/skills/（Claude Code 会自动发现该目录，技能以目录名直接加载），而不是使用上面的 wrapper。两种方式二选一即可。

先保留一个专用的稳定 clone（只用于同步技能，请不要在里面做开发提交）：

mkdir -p ~/ai-skills
git clone https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git ~/ai-skills/nature-skills

首次安装，把技能复制进 Claude Code 的技能目录：

~/ai-skills/nature-skills/scripts/autoupdate-skills.sh --force

然后在 ~/.claude/settings.json 里加一个 SessionStart 钩子（若已有 hooks，把这一项合并进去，不要整体覆盖）：

{
  "hooks": {
    "SessionStart": [
      {
        "hooks": [
          {
            "type": "command",
            "command": "$HOME/ai-skills/nature-skills/scripts/autoupdate-skills.sh",
            "async": true,
            "timeout": 120
          }
        ]
      }
    ]
  }
}

async: true 让它在后台运行、不阻塞启动。脚本自带保护：默认 1 小时内不重复联网检查、断网或拉取失败自动跳过（exit 0，绝不卡住会话）、上游变化或安装目录发生漂移时重新同步、并且拒绝在有未提交改动的 clone 上强行前进。拉到的新版会在下一次开启会话时生效（当前会话的技能已经加载完毕）。每个安装目标使用独立日志，路径为 ~/.local/state/nature-skills/<目标目录编号>/autoupdate.log。

目标目录与检查频率都可配置：

# 默认同步到 ~/.claude/skills；用 --dest 指到别处，例如 Codex：
~/ai-skills/nature-skills/scripts/autoupdate-skills.sh --dest ~/.codex/skills
# 最多每小时联网检查一次；每次运行仍会校验本地安装：
~/ai-skills/nature-skills/scripts/autoupdate-skills.sh --throttle 3600

需要安装或更新完整技能集时，可以使用仓库自带脚本。脚本会同步 skills/ 下所有顶层技能目录，并在复制后做 diff 验证；它不会覆盖其他无关 Codex skills。只需要部分技能时，使用上面的 npx skills 按需安装方式。

git clone https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git
cd nature-skills
scripts/update-codex-skills.sh --pull

如果已经 clone 过仓库：

cd nature-skills
scripts/update-codex-skills.sh --pull

验证当前 Codex 安装是否和这个 checkout 一致：

scripts/update-codex-skills.sh --check

如果你长期用这个脚本更新，并希望清理上游已经删除的旧技能目录：

scripts/update-codex-skills.sh --pull --prune

--prune 只会删除以前由这个脚本记录过、但当前仓库已经不再包含的目录。第一次运行没有历史记录时，它不会猜测删除旧目录。

也可以把仓库链接交给 Codex，让 Codex 执行安装脚本。推荐提示词：

请从这个仓库安装 Codex skills：
https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git

请 clone 仓库后运行 scripts/update-codex-skills.sh --pull。
安装后再运行 scripts/update-codex-skills.sh --check 验证。
请保留 skills/ 下的完整技能目录，不要只复制 SKILL.md。

如果只安装单个技能，请明确说明技能名：

只安装这个仓库里的 nature-reader：
https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git

如果该技能需要共享文件，也请一并安装 skills/nature-shared。

关键规则：保留完整目录结构。请复制或引用整个技能文件夹，而不是只复制 SKILL.md，因为许多技能依赖 references/、static/、manifest.yaml、脚本、资产或共享文件。

安装脚本不会自动安装 Python 依赖。需要使用相关脚本或 MCP 服务时，再按需安装：

python -m pip install -r skills/nature-paper-to-patent/requirements.txt
python -m pip install -r skills/nature-paper-to-patent/scripts/disclosure/requirements-cnipa.txt  # 可选：国知局公布公告检索
python -m pip install -r skills/nature-academic-search/mcp-server/requirements.txt

如果启用 nature-paper-to-patent 的国知局公布公告检索，还需要执行 python -m playwright install chromium。

nature-academic-search 的 MCP 服务还需要单独配置 PUBMED_EMAIL，Scopus / ScienceDirect 等可选 provider 需要使用本机凭据配置，不要把 API key 写入仓库文件。

安装后，请开启一个新的 Codex 会话，然后自然描述任务，例如：

把这篇论文做成中英文对照的完整 Markdown reader。

把这篇论文做成中文PPT。

如果你使用 OpenClaw、OpenCode、Hermes 等开源 agent / 编程框架，请看 OpenClaw / OpenCode / Hermes 接入教程。

自动更新（可选）

Codex 支持全局 SessionStart hook。保留一个专用 clone 后，可以在每次启动或恢复 Codex 会话时检查更新，并把新版同步到 ~/.codex/skills/。

先创建专用 clone 并完成首次同步：

mkdir -p ~/.codex
git clone https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git ~/.codex/.nature-skills-src
~/.codex/.nature-skills-src/scripts/autoupdate-skills.sh \
  --dest ~/.codex/skills --force

然后创建或合并 ~/.codex/hooks.json：

{
  "hooks": {
    "SessionStart": [
      {
        "matcher": "startup|resume",
        "hooks": [
          {
            "type": "command",
            "command": "/bin/bash \"$HOME/.codex/.nature-skills-src/scripts/autoupdate-skills.sh\" --dest \"$HOME/.codex/skills\"",
            "timeout": 120,
            "statusMessage": "Checking Nature Skills updates"
          }
        ]
      }
    ]
  }
}

若 hooks.json 中已有其他 hook，请合并 SessionStart 项，不要整体覆盖。首次启用或修改 hook 后，在 Codex 中运行 /hooks 检查并信任它。Codex 当前按同步方式执行 command hook，因此这里依靠脚本自带的 1 小时节流、60 秒网络保护和断网自动跳过，避免每次会话都重复联网或因更新失败阻断启动。即使上游版本未变化，脚本也会验证安装目录并在发现漂移时重新同步。

每个安装目标使用独立日志，路径为 ~/.local/state/nature-skills/<目标目录编号>/autoupdate.log。拉取到的新技能通常在下一次会话中完整生效。

Chatbox 桌面版提供图形化 Skills 管理界面。请使用带有「设置 → 技能（Skills）」入口的版本；本节适用于桌面端。

从 GitHub 安装

1. 打开 Chatbox 的「设置 → 技能」，点击「从 GitHub 安装」。
2. 粘贴 https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills，点击「扫描」。
3. 勾选需要的技能，点击「安装已选」。初次体验可选择 nature-polishing 和 nature-shared；需要整套技能时可以「全选」。
4. 在「已安装技能」中确认安装结果，并确认需要使用的技能已启用。

nature-shared 是共享支持包。使用 nature-polishing、nature-writing、nature-response、nature-reader 或 nature-paper2ppt 等引用它的技能时，需要一并安装；它不作为独立任务调用。安装单个技能不会自动补齐其他技能依赖。列表可能显示技能的 frontmatter 名称，例如 nature-proposal-writer 显示为 researchwrite。

开始使用

新建对话，选择支持工具调用的模型，开启「智能体模式（Agent Mode）」。把待处理文本粘贴到对话中，并明确写出技能名。例如：

请使用 nature-polishing，把下面这段中文改写为 Nature 风格英文。
保持原有学术含义、数值和结论边界，列出主要修改及理由：

[在这里粘贴论文段落]

需要读论文时，可安装 nature-reader 和 nature-shared，提供论文文件或可访问的本地路径，再请求：

请使用 nature-reader，把这篇论文做成图文对应的中英文对照 Markdown reader，
保留公式和来源锚点，并将产物保存到我指定的输出目录。

检查对话中的技能加载和工具执行记录，确认实际加载了所需技能。若未触发，先检查技能开关、智能体模式以及当前模型是否支持工具调用。

运行依赖与更新

Skills 安装的是指令和配套文件。Python/R、PDF/PPTX 工具、浏览器和 MCP 服务等运行依赖仍需按具体技能说明配置；涉及本地文件或脚本时，按 Chatbox 提示授权所需目录和命令。生成图片等外部服务需要对应服务的凭据。安装成功不代表这些外部能力已配置完成。

在技能的操作菜单中可「检查更新」并按提示更新；有共享依赖时也要检查 nature-shared。如果 GitHub 扫描或下载失败，可从本仓库的「Code → Download ZIP」下载并解压，点击 Chatbox 的「打开技能文件夹」，将所需的完整技能目录及 nature-shared 放到该文件夹的同一级，然后刷新技能列表并启用。保留 references/、static/、脚本和资产；不要只复制 SKILL.md。手动复制时，目录名应与 SKILL.md 中的 name 一致（例如将 nature-proposal-writer 目录命名为 researchwrite）。手动复制的技能需要手动更新。

OpenClaw、OpenCode、Hermes 的具体接入方式见 OpenClaw / OpenCode / Hermes 接入教程。

用于其他 agent 时，建议保留一个稳定的仓库 clone，再创建轻量 subagent、slash command 或 custom prompt wrapper，指向真实的 skills/*/SKILL.md，并保留 skills/nature-shared/。

手动或其他 agent 使用时：

1. 将完整技能目录复制到你的 prompt library 或项目中。
2. 保留 SKILL.md、manifest.yaml、static/、references/、脚本、资产和需要的 skills/nature-shared/ 文件。
3. 如目标 agent 有自己的格式要求，可调整 frontmatter 和正文结构。

当前 skills/ 下包含以下可触发技能；skills/nature-shared/ 是共享内容目录，不计入技能索引。点击技能名或“详情页”可以进入每个 skill 的单独说明页面。

所有技能都遵守以下原则：

1. 优先使用一手来源：规则基于已发表 Nature 内容、官方期刊指南或明确的本地来源，而不是泛泛审美偏好。
2. 显式胜过隐式：每条规则都应说明理由，而不是只给断言。
3. 感知章节与任务上下文：学术写作、图件、引用和回复都依赖上下文；不同论文部分使用不同逻辑。
4. 输出优先：每个技能都应返回能直接使用的产物，例如可粘贴文本、.svg、.pptx、.docx 或具体建议。
5. 可扩展：每个技能自包含在自己的目录中，新增技能不应要求修改既有技能。

skills/
├── nature-shared/              # 当技能引用 ../nature-shared 时需要保留
├── nature-<topic>/
│   ├── README.md
│   ├── README_EN.md
│   ├── SKILL.md
│   ├── manifest.yaml     # router-style 技能会包含
│   ├── static/           # router-style 技能会包含
│   └── references/...
└── nature-proposal-writer/
    ├── README.md
    ├── README_EN.md
    ├── SKILL.md
    ├── scripts/...
    ├── templates/...
    └── references/...

向本仓库添加技能时，请按以下流程：

1. 创建技能目录

skills/nature-<topic>/

2. 添加必需文件

3. 编写中英文 README

每个新增技能都必须同时提供 README.md 和 README_EN.md。README 是面向人的技能入口页，不是 SKILL.md 的重复版，也不是安装手册。它的目标是让用户在 30 秒内判断：这个 skill 能不能解决我的问题、我要给它什么、它会产出什么、边界在哪里。

基本规则：

• 中文 README 和英文 README 必须一一镜像：标题数量一致、顺序一致、信息点一致；英文页不要写成另一套独立模板。
• 顶部固定为技能名、语言切换链接和一句定位说明。
• 默认使用下面的基础结构；只有确实需要时才插入可选章节。
• 不要在单个 skill README 中重复仓库安装教程、作者信息、变更日志、开发过程、完整文件树或大段内部实现细节。
• 复杂规则、API 参数、长教程、脚本说明和模板索引应放进 references/、static/、scripts/ 或 SKILL.md，README 只保留路标。
• 如果技能有视觉资产，可以放一个小型预览表；不要把 README 变成大型图库或长篇技术手册。

中文 README 基础结构：

# `nature-<topic>` 技能

[English](README_EN.md)

一句话说明这个技能的定位、主要任务和使用边界。

## 适合用它做什么
## 典型请求
## 你需要提供
## 产出
## 边界
## 相关技能

英文 README 必须对应为：

# `nature-<topic>` Skill

[中文说明](README.md)

One sentence describing the skill's role, main task, and usage boundary.

## What To Use It For
## Typical Requests
## What You Need To Provide
## Outputs
## Boundaries
## Related Skills

可选章节必须中英文同步插入，并保持相同顺序。常见可选章节包括：

提交前至少做这些 README 检查：

python scripts/validate-readmes.py
git diff --check
for d in skills/nature-*; do
  [ -f "$d/README.md" ] && [ -f "$d/README_EN.md" ] || continue
  rg -q '^\[English\]\(README_EN\.md\)$' "$d/README.md"
  rg -q '^\[中文说明\]\(README\.md\)$' "$d/README_EN.md"
  test "$(rg -c '^## ' "$d/README.md")" = "$(rg -c '^## ' "$d/README_EN.md")"
done

4. 录制使用教程

提交 PR 时，请同时录制一个简短的使用教程，说明这个 skill 解决什么问题、如何触发、需要什么输入，以及会产出什么结果。可以在 PR 描述中附上视频、录屏链接或可公开访问的教程地址。

5. 配置 SKILL.md frontmatter

---
name: nature-<topic>
description: >-
  用一句话说明这个技能做什么、什么时候触发、主要输出格式和核心使用场景。
---

6. 更新技能索引

在上方 技能索引 表格中添加一行：

| [`nature-<topic>`](skills/nature-<topic>/README.md) | Draft / Stable | 一句话用途 | 触发词 | [详情](skills/nature-<topic>/README.md) |

7. 设置状态标签